В 4 серии 1 сезона аниме «Туалетный мальчик Ханако» развивается сюжет вокруг главной героини, Нэне Ясиро, и её взаимодействий с мистическим мальчиком по имени Ханако. В этой серии Нэне продолжает исследовать сверхъестественные события, окружающие туалеты школы, и сталкивается с новыми загадками.
События разворачиваются вокруг духа, связанного с одной из туалетных легенд. Нэне и её друзья пытаются разобраться в том, как его можно успокоить и освободить от привязанности к этому месту. Серия наполнена напряжёнными моментами, как с мистической стороны, так и с элементами комедии, что делает её интересной и увлекательной.
В ходе приключения герои узнают больше о прошлом духа и о том, как важно понять его чувства, чтобы помочь ему перейти в другой мир. В конечном итоге, Нэне и Ханако становятся ближе, укрепляя свои дружеские отношения.